Результаты поиска по тегу «Биоинформатика» 12 результатов

  • Программа для анализа метагенома выявила новые причины возникновения супербактерий

    Ученые из Университета ИТМО и ФНКЦ физико-химической медицины разработали алгоритм поиска в ДНК микрофлоры кишечника генов, обеспечивающих устойчивость бактерий к антибиотикам, а также предсказали возможность передачи таких генов от одного вида бактерий другому. Метод основан на реконструкции геномного окружения заданного участка ДНК. Новая программа поможет разрабатывать эффективные схемы лечения инфекций и сдерживать появление супербактерий, неуязвимых для большинства лекарств. Результаты опубликованы в журнале «Bioinformatics».

  • HelloDNA: как научиться выравнивать последовательности ДНК, играя в тетрис, и зачем это нужно

    Как устроен геном и зачем его секвенируют, что такое риды и почему выровнять нуклеотидные последовательности не так-то просто? Зачастую обычный пользователь, далекий от биоинформатики, даже не задумывается, как выглядит ДНК и что стоит за базовыми процессами, происходящими в его организме. Чтобы решить эту проблему, студентки Института биоинформатики и научные журналисты Юлия Кондратенко и Анастасия Гайнуллина вместе с выпускником Университета ИТМО Даниилом Друкаревым создали мобильное приложение HelloDNA. Играя в тетрис, любой желающий сможет самостоятельно добиться лучшего выравнивания двух последовательностей ДНК. Подробнее о проекте и о том, как помочь сделать биоинформатику понятной даже ребенку, они рассказали в интервью ITMO.NEWS, приуроченному к международному дню ДНК. Поиграть в адаптированную версию игры вы можете здесь, а скачать игру на мобильный с Google Play — по ссылке. 

  • Геномный «тетрис» и анализ движения лабораторных мух: проекты первого хакатона по биоинформатике BioHack

    В минувшие выходные на площадке Университета ИТМО прошел первый в Петербурге хакатон по биоинформатике BioHack. 48 часов 24 команды анализировали десятки тысяч научных публикаций, моделировали эволюционные процессы, писали игры по биоинформатике и ПО, анализирующее движение лабораторных мух, секвенировали геном гепарда и, борясь с недостатком данных и усталостью, решали другие задачи. Что из этого вышло? Читайте в нашем материале.

  • Собрать метагеном за 24 часа: результаты первой олимпиады по биоинформатике Bioinformatics Contest 2017

    В конце февраля завершилась первая олимпиада по биоинформатике Bioinformatics Contest 2017. Соревнования были организованы Институтом биоинформатики, а все задачи готовили выпускники и студенты Университета ИТМО. На протяжении двух недель три тысячи программистов и специалистов по биоинформатике со всего мира пытались пробиться в финальный раунд, где всего за 24 часа им предстояло заново собрать метагеном, найти неизвестную вставку в модифицированной ДНК, а также многое другое. О результатах соревнований и о том, почему ответы на некоторые задачи изначально не знало на 100% даже само жюри, нам рассказал один из координаторов олимпиады, аспирант Университета ИТМО Виталий Аксенов.

  • Визуализация и вычисления: какие перспективы видят норвежские ученые в вузах России

    Научно-исследовательский институт наукоемких компьютерных технологий Университета ИТМО обрел нового партнера в лице Университета Осло. Норвежцы заключили с петербургскими коллегами меморандум о взаимопонимании, и впереди у обоих вузов совместные образовательные и научные проекты. Почему Университет ИТМО привлек норвежских ученых, чем интересен НИИ НКТ для биоинформатиков и офтальмологов, как будут развиваться совместные образовательные программы — в нашем материале.

  • Дела сердечные: как программисты и медики ищут причины заболеваний сердца

    Сердечно-сосудистые заболевания потенциально опасны для каждого человека — тем важнее знать их глубинные причины. Во Всемирный день сердца мы публикуем материал о том, как спортивные программисты и молодые ученые кафедры компьютерных технологий Университета ИТМО вместе со специалистами из Северо-Западного федерального медицинского исследовательского центра имени В. А. Алмазова пытаются найти первопричины различных сердечных заболеваний. Вместе они ищут в огромном объеме информации гены, ответственные за ряд заболеваний, — от кардиомиопатий до врожденных пороков сердца и не только.

  • Летняя школа по биоинформатике собрала начинающих исследователей в области генетики, медицины, информатики

    В конце июля в Петербурге состоялась четвертая Летняя школа по биоинформатике для студентов и молодых ученых. На событие съехались 100 участников из университетов по всей России. В течение пяти дней они работали над научными проектами, выступали на конференции с докладами, слушали лекции российских и зарубежных ученых-профессионалов. В этом году программа школы была сосредоточена на крайне актуальной теме – медицинской биоинформатике.

  • Ученые из РФ открыли алгоритм быстрого сопоставления ДНК разных микробов

    Информационное агентство России «ТАСС» подготовило материал об открытии ученых из Университета ИТМО, Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины и Московского физико-технического института, которые разработали программу для анализа и сравнения между собой совокупностей ДНК микроорганизмов, обитающих в разных средах. Сравнение микрофлоры здорового человека с микрофлорой больного при помощи данного алгоритма позволит быстро выявить ранее неизвестные патогенные организмы, а также их штаммы, что поспособствует разработке средств персонализированной медицины.

  • Ученые создали бесплатный веб-сервис для глубинного изучения работы клеток организма

    Группа ученых из России, США, Канады и Германии разработала простой и эффективный веб-сервис GAM («Genes and Metabolites») для комплексного изучения биологических процессов в клетках. Программа обнаруживает связи между изменениями в метаболизме и генах, что позволяет ученым разобраться, как функционируют, например, клетки иммунной системы или опухоли — биологические объекты, в которых метаболическая регуляция играет важную роль. Выводы, полученные с помощью сервиса, могут быть применены при разработке лекарств против аутоиммунных заболеваний и рака. Результаты работы были опубликованы в журнале Nucleic Acids Research.

  • Считаем жизнь: что такое биоинформатика

    Расшифровка последовательностей генов давно перестала быть невыполнимой задачей для ученых – при желании даже частные лица могут заказать «распечатку» своего генома. Но чтобы читать книги, недостаточно просто выучить буквы и слова – нужно знать значения этих слов. Именно этим занимается структурная биоинформатика: разрабатывает алгоритмы анализа последовательностей для предсказания пространственной организации белков, от которой зависят их функции.

Архив по годам:
Пресс-служба