В результате проведения двух туров конкурсного отбора пилотных проектов в рамках реализации «Программы развития НИУ ИТМО на 2009—2018 гг.» было подано 24 заявки.
4 февраля 2013 г. на заседании Координационного Совета были объявлены следующие победители:
- Пилотный проект № 1 «Использование оптических технологий при получении биологически активных веществ» — руководитель Л. А. Забодалова
- Пилотный проект № 2 «Автоматизация безопасного доступа к корпоративному учебному облаку» — руководитель С. Э. Хоружников
- Пилотный проект № 3 «Лазерно-ультразвуковая диагностика» — руководитель М. Я. Марусина
- Пилотный проект № 4 «Лаборатория компьютерной криминалистики и расследования преступлений в области информационных технологий» — руководитель И. А. Зикратов
- Пилотный проект № 5 «Аэротермоакустическая обработка (АТАО) металлов» — руководитель С.А. Вологжанина
- Пилотный проект № 6 «Смарт-полимерные системы» — руководитель М. В. Успенская
- Пилотный проект № 7 «Развитие Лаборатории медицинских информационных и диагностических систем на базе Центра медицинского, экологического приборостроения и биотехнологий НИУ ИТМО» — руководитель С.А. Тараканов
- Пилотный проект № 8 «Лаборатория четырехмерного интерактивного моделирования местности» — руководитель А.Г. Карманов
- Пилотный проект № 9 «Лаборатория систем передачи информации и навигации на базе mesh-технологий» — В. А. Григорьев
- Пилотный проект № 10 «Технологии проектирования реконфигурируемых «систем на кристалле»» — руководитель А. Е. Платунов
- Пилотный проект № 11 «Лаборатория информационно-расчетных задач радиотехнических средств управления воздушным движением» — руководитель И. А. Зикратов
- Пилотный проект № 12 «Лаборатория проблем информационной безопасности технологии RFID» — руководитель И. А. Зикратов
- Пилотный проект № 13 «Лаборатория технологий захватной визуализации» - руководитель В. М. Мусалимов
- Пилотный проект № 14 «Технологии проектирования и производства оптических изделий из термопластичных полимерных материалов» — руководитель Е. И. Яблочников
- Пилотный проект № 15 «Сейсмическая донная станция на основе волоконных решеток Брэгга» — руководитель И. К. Мешковский
- Пилотный проект № 16 «Информационно-оптические методы и технологии в промышленной экологии» — руководитель Н. Р. Тойвонен