Ученые из РФ открыли алгоритм быстрого сопоставления ДНК разных микробов

Ученые из РФ открыли алгоритм быстрого сопоставления ДНК разных микробов

Информационное агентство России «ТАСС» подготовило материал об открытии ученых из Университета ИТМО, Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины и Московского физико-технического института, которые разработали программу для анализа и сравнения между собой совокупностей ДНК микроорганизмов, обитающих в разных средах. Сравнение микрофлоры здорового человека с микрофлорой больного при помощи данного алгоритма позволит быстро выявить ранее неизвестные патогенные организмы, а также их штаммы, что поспособствует разработке средств персонализированной медицины.

Программный инструмент под названием MetaFast, разработанный учеными, позволяет провести быстрый сравнительный анализ большого количества метагеномов.

«При исследовании микрофлоры кишечника пациентов могут быть выявлены микроорганизмы, ассоциируемые с каким-либо заболеванием, например, с диабетом или предрасположенностью к нему. А это уже предпосылки для применения персонализированной медицины и создания новых лекарств. Оперируя результатами работы программы, биологи могут сделать выводы о том, в каком направлении двигаться, поскольку алгоритм позволяет исследовать среды, о которых мы еще ничего не знаем», — рассказывает главный разработчик алгоритма Владимир Ульянцев, сотрудник Международной лаборатории «Компьютерные технологии» Университета ИТМО.

Одной из ключевых особенностей программы является возможность успешно работать со средами, генетическое содержимое которых ранее не было изучено.

С полной версией материала можно ознакомиться на сайте ТАСС.

Пресс-служба Университета ИТМО

Архив по годам:
Пресс-служба